El Batallón de Cuartel General se compone de Unidad de Mando, de Plana Mayor, de Cuartel General y de Música entre otras.
El Batallón de Cuartel General de la Comandancia General de Ceuta es una Unidad independiente constituida para apoyar y satisfacer diferentes requerimientos operativos del Cuartel General en particular y de la Comandancia General de Ceuta en general.
Para cumplir su misión, el Batallón de Cuartel General se organiza en una estructura heterogénea, con Unidades de Mando, de Plana Mayor, de Cuartel General (responsable del establecimiento y protección de los Puestos de Mando de la Comandancia General, así como de apoyo logístico, seguridad y mantenimiento de las instalaciones del Cuartel General), de Música (que proporciona la solemnidad y realce que requieren los diferentes Actos, desfiles y conciertos ejecutados en la Comandancia General) y otras.